Le Trouble du Développement Intellectuel (TDI) est un défaut de développement des compétences cognitives survenant dès le début de l’enfance. Malgré les progrès de la génétique, la cause de ce trouble du neurodéveloppement n’est pas identifiée dans environ 50% des cas. Le projet ENCode-ID, porté par le Dr Laïla el-Khattabi au sein de l’équipe du Pr Bassem Hassan et en collaboration avec les équipes de génétique clinique et biologique d’AP-HP / Sorbonne Université (Hôpitaux Armand Trousseau et Pitié-Salpêtrière) et des CHU de Lille et de Rennes, vient de recevoir le soutien du mécénat santé des Mutuelles AXA à l’occasion du 2e appel à projet lancé en février 2023. ENCode-ID vise à déterminer de nouvelles causes génétiques, des biomarqueurs de sévérité ainsi que de nouvelles pistes thérapeutiques.
Retard dans l’apparition du langage, dans l’acquisition de la propreté, dans l’apprentissage de la lecture… les manifestations en bas âge d’un retard du neurodéveloppement sont nombreuses. Lorsque les jalons neurodéveloppementaux ne sont pas acquis au même âge que les autres enfants, il est possible que l’enfant présente un Trouble du Développement Intellectuel (TDI). Variable dans sa sévérité, ce trouble touche entre 1 et 2 % de la population. Son impact sur les enfants ainsi que sur leurs familles en fait un problème majeur de santé publique.
Le diagnostic génétique au cœur de la prise en charge du trouble du développement intellectuel
Les anomalies génétiques responsables de TDI sont très nombreuses et hétérogènes, ce qui rend leur diagnostic difficile. Les progrès technologiques majeurs des dernières années ont permis d’augmenter considérablement le rendement diagnostique, passant de 5 % il y a une dizaine d’années à 50 % actuellement. Cette progression, si elle est notable, reste insuffisante puisque la moitié des patientes et patients touchés par un TDI restent sans diagnostic. Or, de nombreuses études soulignent l’impact positif du diagnostic en termes de prise en soins, d’acceptation de la pathologie, de la déculpabilisation des parents et de l’arrêt de l’errance diagnostique.
Le diagnostic génétique est donc un des défis majeurs des années à venir pour les troubles du développement intellectuel.
Explorer le génome non codant pour améliorer le diagnostic du trouble du développement intellectuel
Le projet d’étude de recherche médicale translationnelle ENCode-ID mené à l’Institut du Cerveau par le Dr Laïla El-Khattabi vise à améliorer le taux diagnostique du TDI en élucidant le rôle des variations génétiques dans les séquences non codantes du génome. Ces travaux devraient avoir un impact immédiat sur les patientes et patients ainsi que sur leurs familles, en particulier en termes de prise en soins et de conseil génétique. Par ailleurs, ils généreront une quantité considérable de données qui pourront être exploitées tout à la fois par les équipes de l’Institut du Cerveau et par la communauté internationale.
Dr Laïla El-Khattabi
ENCode-ID est la première étude à proposer une approche globale d’études fonctionnelles de grande échelle de mutations dans les régions régulatrices non codantes du génome. Si le projet est innovant par son approche, il l’est également par les techniques qu’il met en œuvre (édition multiplex du génome, utilisation d’organoïdes cérébraux comme modèle, techniques d’analyse sur cellule unique et outils bioinformatiques novateurs).
En outre, cette étude est la seule à proposer aujourd’hui une exploration in silico des voies thérapeutiques pour le TDI dans un modèle proche du développement cérébral précoce chez l’humain en utilisant un algorithme de restauration des trajectoires développementales altérées. Tout cela est rendu possible grâce aux compétences développées dans l’équipe porteuse, à la collaboration avec des équipes cliniques référentes dans ce type de trouble et à l’environnement unique de l’Institut du Cerveau en termes d’expertise et de plateformes technologiques et bioinformatique.
L’approche globale innovante du projet ENCode-ID soutenue par le programme de mécénat santé des Mutuelles Axa
Fort de ce contexte, le projet ENCode-ID a obtenu le soutien des Mutuelles AXA et sera financé, pour une durée de 2 ans, par son mécénat santé dans le cadre de son programme dédié au soutien d’initiatives de recherche innovante en France.
Le programme de mécénat santé lancé par les Mutuelles AXA début 2022 est un nouvel engagement qui complète ses axes traditionnels de mécénat : Solidarité, Environnement et Territoires.
L’Institut du Cerveau et ses équipes remercient les Mutuelles Axa pour leur engagement à leurs côtés.