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Un(e) neurologue PH (H/F)

L’Institut du cerveau est un centre de recherche totalement dédié à la recherche sur les maladies neurologiques et neurodégénératives, qui comprend en son sein des cliniciens chercheurs, des chercheurs en neuroscience et fondamentaux. L’institut s’appuie sur des ressources exceptionnelles dans les domaines de la neuro-imagerie, de la génétique, des neurosciences cognitives, de la biologie, de l’électrophysiologie. L’équipe travaille sur les démences dégénératives, en particulier sur les démences Frontotemporale (DFT) en liaison étroite avec les équipes médicales de l’institut de la mémoire et de la maladie d’Alzheimer (IMMA).

Le(a) candidat(e) participera à des projets de recherche clinique sur les démences dégénératives au sein de l’ICM. Les projets de l’équipe portent sur les formes génétiques de DFT. Il s’agit de projets de recherche clinique et translationnelle, visant à identifier des marqueurs biologiques, d’imagerie cérébrale (IRM/TEP) et troubles cognitifs précoces de la DFT, et leurs bases neuroanatomiques.

Les données exploitées par le(a) candidat(e) sont issues de cohortes de patients DFT (Predict-PGRN PrevDemALS et RBM02-59).

Possibilité d’une activité de soins (consultations à l’IMMA) en complément de l’activité de recherche.

Le contrat est renouvelable et peut s’intégrer dans le cadre d’une thèse de sciences si souhaité.

Possibilité de participer à de nombreuses formations à l’évaluation cognitive des patients, aux outils statistiques et d’analyses d’imagerie au sein de l’institut (ICM) et de l’équipe clinique qui y est rattachée (IMMA).

Participation à des congrès nationaux et internationaux, intégration dans les réunions des consortiums de recherche, présentation des résultats aux congrès, participation aux publications de recherche.

Il/Elle participera au recrutement des patients, à leur évaluation clinique et à leur suivi, et à l’analyse des données.

Le(a) candidat(e) travaillera à l’interface de deux équipes de l’ICM : l’équipe BTWIN (génétique) et FrontLab (neurosciences cognitives) sous la responsabilité du Dr Isabelle Le Ber. Au sein de l’équipe, il/elle interagira avec des cliniciens chercheurs, chercheurs, cheffe de projet, neuropsychologues et orthophonistes, et personnel technique.

Il/elle interagira étroitement avec l’équipe clinique (IMMA) et l’équipe ARAMIS (analyses d’imagerie) ainsi qu’avec les nombreuses équipes de l’ICM et le LIB.

Travail en relation avec les équipes cliniques (IMMA),

 

PROFIL

Savoir-faire

  • Le(a) candidat(e) devra être neurologue expérimenté(e), titulaire d’un DES de neurologie (ou éventuellement en fin de cursus de formation).
  • Idéalement, un master, une bonne connaissance des pathologies cognitives et comportementales, des outils informatiques et des analyses statistiques et logiciels d’analyse d’imagerie seraient un plus. 
  • Responsabilité du bon déroulement des projets, de la réalisation des analyses, de l’évaluation des patients, des gestions de cohortes, publications et présentation aux congrès. Suivi bibliographique sur la thématique de recherche.

Savoir

  • Connaissance sur les DFT, cognition, statistiques, logiciels d’analyse d’imagerie
  • Bonne maitrise de la langue française et anglaise

 

Savoir-être

  • Bonne intégration dans les équipes de recherche, respect des autres, respect des horaires de travail, des règlements au sein de l’ICM et de l’IMMA, BPC.
  • Capacité à travailler en équipe, dynamisme, autonomie, et curiosité scientifique.

Un(e) post-doctorant(e) (H/F)

Le(a) post-doctorant(e) recruté(e) sera en charge d’un programme de recherches visant à caractériser in vivo dans un modèle génétique d’épilepsie-absence les effets aigus et les effets à long-terme de stimulations magnétiques de basse intensité (LI-rTMS) sur la fréquence de survenue et la durée des crises. Le(a) chercheur(se) devra notamment réaliser des enregistrements EEG combinés à des enregistrements intracellulaires chez des animaux ayant reçu une session unique (effet aigu) ou des sessions répétées (effet à long-terme) de stimulations magnétiques. Le travail expérimental du (de la) chercheur(se) recruté(e) sera réalisé dans l’équipe de Stéphane Charpier au sein de l’ICM. Une expérience dans un laboratoire de recherche en électrophysiologie depuis plus de 5 ans est requise.

Missions principales :

  • Réalisation d’enregistrements EEG, LFP et intracellulaires de neurones corticaux dans un modèle de rongeur in vivo.
  • Analyse et traitement des signaux électrophysiologiques
  • Marquage intracellulaire ou juxta-cellulaire in vivo des neurones, perfusion, traitement histologique, reconstruction 3D (avec l’aide d’une histologiste)
  • Rédaction de publications scientifiques
  • Supervision d’un étudiant en thèse
  • Enregistrements EEG et LFP chez des animaux vigils ayant subi 10 jours de stimulation avec l’aide de la plateforme Phenoparc

 

Savoir-faire

  • Maîtrise des techniques d’enregistrements intracellulaires et extracellulaires (EEG, LFP, multi- et single-unit) in vivo
  • Maîtrise des outils informatiques permettant l’analyse des données (Spike2, MatLab, Origin, Igor)
  • Maîtrise des techniques de marquage cellulaire in vivo
  • Fabrication d’électrodes

 

Savoir

  • Doctorat en Neurosciences ou équivalent
  • Formation à l’expérimentation animale (niveau 1 et niveau de chirurgie souhaitable)
  • Expertise théorique en électrophysiologie cellulaire et de réseau
  • Connaissances approfondies en physiologie animale et en anesthésiologie
  • Connaissances en électronique
  • Connaissance des techniques de pharmacologie et d’immunohistochimie
  • Connaissance théoriques et techniques en LI-rTMS
  • Maîtrise de l’anglais écrit et parlé

Savoir-être

  •  Autonomie, sens de l’initiative, sens du contact 

Un(e) Ingénieur(e) de Recherche (H/F)

Missions principales

  • L’ingénieur de recherche est chargé de l’analyse des données électrophysiologiques obtenues lors d’expérimentations dans le cadre de protocoles de recherche biomédicale portant sur la personne humaine.
  • Interactions avec l’équipe (cliniciens, chercheurs, ARC, etc…)
  • Réaliser le traitement et l’analyse des données en vue de leur interprétation,
  • Evaluer les différentes méthodes d’analyse et choisir les plus appropriées selon les objectifs du programme de recherche
  • Proposer des évolutions dans l’analyse des données électrophysiologiques en fonction des besoins nouveaux
  • Organiser et contrôler les interventions de maintenance préventive et les interventions de dépannage

Savoir-faire

  • Il/elle saura réaliser les systèmes de prise de mesure, d’acquisition et de traitement des données ainsi que traduire une demande en spécifications techniques.
  • Il/elle saura planifier une demande en spécifications techniques.

 Savoir

  • Le/la candidat(e) aura un niveau ingénieur (thèse de science) avec une expérience professionnelle en qualité d’ingénieur de recherche dans le domaine de l’électrophysiologie et l’analyse du mouvement.
  • Le/la candidat(e) aura des connaissances approfondies des méthodes d’analyse et du traitement du signal électrophysiologique
  • Il/elle maitrisera les logiciels suivants : logiciel d’acquisition, MATLAB (the MathWorks®), Pack Office (Word, Excel, Powerpoint), statistiques (R®)
  • Il/elle aura de bonnes connaissances en statistiques
  • Il/elle maîtrisera l’anglais technique lu et écrit

Savoir-être

  • Le/la candidat(e) s’intégrera dans une équipe dynamique et travaillera en étroite relation avec le responsable du projet et d’autres chercheurs/personnel technique.
  • Il/elle fera preuve d’une grande autonomie, d’un bon relationnel, ainsi que d’une bonne capacité d’interaction et de communication.
  • Le/la candidat(e) sera amené(e) à être en contact direct avec les sujets venant participer aux expérimentations (volontaires et patients atteints de pathologies neurologiques)

INGENIEUR DE RECHERCHE « Data manager d’enregistrements intracérébraux multi-niveaux neurophysiologiques » (h/f)

OBJECTIFS :

 

Le candidat sera en charge de la gestion d’une base de données unique, ayant déjà inclus plus de 60 patients épileptiques.

Cette base inclue des enregistrements EEG obtenus par des électrodes intracérébrales, placées dans le but d’identifier l’origine des crises chez des patients ayant une épilepsie qui résiste aux traitements médicamenteux, et de leur proposer une exérèse neurochirurgicale de cette région focale. Les signaux sont recueillis dans leur intégralité, 24 heures sur 24, et 7 jours sur 7, ceci durant 2 à 3 semaines. Plus d’une centaine de contacts d’électrodes sont enregistrés en continue. De plus, des microélectrodes sont implantées afin d’effectuer des mesures ‘microscopiques’ des activités de petits groupes de neurones. Enfin, d’autres signaux sont recueillis : des électrodes EEG de scalp, l’ECG, des mesures musculaires afin de pouvoir définir les différents stades de sommeil. Ces signaux sont acquis à l’aide d’un amplificateur ‘recherche’ dans l’Unité d’épilepsie, puis transférés via une fibre optique vers des serveurs de l’ICM. Des nouveaux enregistrements sont réalisés environ une fois par mois.

 

Le candidat devra effectuer plusieurs missions en lien avec la base :

A. Vérification de son intégrité, et de sa sauvegarde, en interaction avec le service Informatique de l’ICM. Gestion des différents serveurs de stockage et de calcul. Au total, l’ensemble des données recueillies pour chaque patient dépasse 1 To.

B. Analyse ‘qualité’ : identification des différentes périodes où le signal est trop artéfacté, et rejet de ces périodes pour les analyses ultérieures. Différentes approches devront être mises en jeu : analyse visuelle au travers d’un logiciel de visualisation des données, et analyse automatisée

C. Analyse des signaux :

1) analyse des signaux EEG :

– Analyse Temps-fréquence, dans différentes bandes de fréquence, sur l’ensemble des électrodes et durant la totalité des enregistrements (en moyenne 15 jours)

– Analyses bivariées, mesurant les liens entre les signaux, comme la synchronie de phase, dans différentes bandes de fréquence.

2) analyse des signaux des micro-électrodes

– Analyse des activités multi-unitaires, obtenues après filtre des basses fréquences.

– Identification de neurones uniques (ou « spike-sorting »), par la morphologie unique de la forme du potentiel d’action, et des propriétés de décharge. Le candidat devra utiliser et enrichir la méthodologie de spike sorting développée dans l’équipe utilisant Matlab et Spyking-Circus, développé par Pierre Yger à l’Institut de la vision. Un développement important devra être effectué afin d’effectuer ces analyses sur des données de longue durée, afin de définir s’il est possible d’identifier le même neurone, durant plusieurs jours de suite. Différentes mesures seront appliquées pour quantifier les fluctuations de ces décharges au cours du temps : fréquence moyenne, régularité de décharge, tendance à décharger en « bouffées ».

3) mesure des propriétés de l’ECG.

4) Mesure des états de vigilance des patients :

– Polysomnographie : identification des différents stades de sommeil. Différentes mesures seront évaluées, et comparées à un scoring manuel, de référence fait par un médecin, sur les 3 premières nuits d’enregistrement.

-d’autres mesures seront employés pour quantifier l’activité des patients (EMG, accéléromètre, etc)

SAVOIR:

– Connaissance des langages Matlab, Python, Gitub

– Connaissance des outils d’analyse des signaux

– Connaissance en statistique

SAVOIR-FAIRE:

– Gestion de bases de données

– Gestion de bases d’analyses multi-modales

SAVOIR – ÊTRE:

  • autonome, travaillant au sein d’une équipe de recherche
  • organisé, car responsable de plusieurs projets
  • rigoureux
  • sociable, car amené à interagir avec une grande diversité d’interlocuteurs (médecins, chercheurs, post-doctorants, neurochirurgien…)
  • curieux

être à l’écoute des besoins de l’équipe pour proposer des solutions adaptées.