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Un(e) assistant ingénieur en techniques biologiques (H/F)

MISSIONS PRINCIPALES

Réalisation de prestations de services dans le cadre de projets académiques ou industriels et rédaction des rapports
Production de cultures cellulaires (cultures primaires, lignées)
Mesure de paramètres biologiques et tests fonctionnels
Imagerie cellulaire
Formation des nouveaux entrants aux principes de base de la culture cellulaire et à l’utilisation des équipements
Acquisition et transmission des savoir-faire et des techniques
Gestion des espaces communs de la plateforme et des stocks de consommables
Supervision du matériel mise à disposition : organisation des maintenances, surveillance
Aide à la gestion administrative de la plateforme : commandes, facturation, inventaire, mailing, affichage…

SAVOIR

Niveau Bac+3
Bonne connaissance des règles d’hygiène et de sécurité
Connaissances générales en biologie
Habilitation en expérimentation animale (niveau opérateur ou concepteur)

SAVOIR – FAIRE

Maîtrise des principes et des techniques de base de culture cellulaire et de biologie cellulaire : production, maintenance et traitements des cultures ; techniques de transfection ; détection par immunofluorescence ; comptage cellulaire ; observation au microscope ; dosages ELISA ; …
Une expérience préalable du travail en plateforme serait un plus
Maîtrise de l’outil informatique : bureautique de base et logiciels de gestion de plannings, de stocks et de commandes
Maîtrise de l’anglais scientifique

SAVOIR – ETRE

Motivation, autonomie, dynamisme, sens de l’organisation et qualités relationnelles
Savoir rendre compte de son activité et transmettre des savoir-faire

Un(e) Ingénieur(e) d’étude(H/F) – Plateforme d’histologie

Au sein de la plateforme d’histologie, l’ingénieur(e) d’étude aura en charge des expériences de transcriptomique spatiale. Elle/il réalisera les coupes de tissus, dédiées à cette technologie innovante d’analyse d’expression de gènes. Elle/il effectuera les expériences de transcriptomique spatiale sur des automates de dernière génération, et assurera le suivi et l’interprétation des expériences, en lien étroit avec les plateformes de génomique et de bio-informatiques de l’Institut du Cerveau. Elle/il devra être capable d’interagir avec les équipes de recherche et discuter les résultats en Anglais et en Français.

Missions principales

Assurer la préparation et la coupe de tissus pour les expériences de transcriptomique spatiale.
Réaliser les expériences d’immunohistochimie et/ou de colorations histologiques, nécessaires à la sélection de régions d’intérêt pour la transcriptomique spatiale
Mettre en place des workflows avancés pour la transcriptomique spatiale, par exemple : segmentation d’images, quantification de la distribution de transcrits et/ou protéines
Réaliser les premières analyses de standards des données de transcriptomique spatiale
Organiser et contrôler l’utilisation collective des appareillages et des postes de travail
Maintenir, répertorier et promouvoir les techniques de transcriptomique spatiale, sous la direction des responsables opérationnel et scientifique de la plateforme
Former les scientifiques à l’utilisation des techniques de transcriptomique spatiale et rédiger des procédures
Conseiller les utilisateurs sur les possibilités techniques, leurs limites, les méthodes d’analyse, leur interprétation, et en assurer le suivi
Rédiger des rapports d’expériences ou d’études, des notes techniques
Travailler en étroite collaboration avec les équipes scientifiques, la plateforme de génomique et d’analyse de données, pour mettre en œuvre des protocoles innovants permettant de localiser et de quantifier, de manière fines, l’expression de gènes ou de protéines.
Participer aux réunions de projet
Communiquer sur les avancées des techniques de transcriptomique spatial lors de conférences scientifiques (internes et externes) ou dans des journaux scientifiques
Assurer l’application des principes et des règles d’hygiène et de sécurité et mettre en œuvre une démarche qualité et un suivi métrologique des équipements
Assurer la veille scientifique dans ce domaine émergeant

PROFIL:

Diplôme requis : Licence à Master ou équivalent
Expérience professionnelle acquise : 3 à 5 ans
Très bonnes connaissances en histologie (coupes, coloration histologiques et immunohistochimie), et en particulier de l’histologie du système nerveux
Très bonnes compétences en biologie moléculaire (ISH, RNAscope, FISH…)
Bonnes connaissances des techniques de génomique (extractions d’ARN, qPCR, RNAseq…)
Notion en analyse de données souhaitée mais non requise (langage R et /ou Python)
Très bonne capacité rédactionnelle et de communication scientifique (Anglais et Français)
Maîtrise des outils informatiques

Autonomie et rigueur
Excellente capacité d’organisation
Excellente capacité de travail en équipe multidisciplinaire

Un(e) Data Manager Senior (H/F)

Nous recherchons actuellement une personne capable de coordonner la gestion des données à l’Institut du cerveau de Paris. Si vous êtes la personne que nous recherchons, vous guiderez, formerez et soutiendrez les équipes et les plateformes de recherche sur la bonne approche pour leur gestion de données. Vous les guiderez tout au long du cycle de vie de leurs données. Cela comprend : la création de plans de gestion des données, l’utilisation de formats et de systèmes corrects, la communication avec la DSI, la communication avec le service juridique et le DPD de l’institut, et le stockage à long terme de l’ensemble de données. Le poste exige la capacité d’assurer la liaison avec un grand nombre d’entités de l’institut, tant dans le domaine scientifique que dans le domaine administratif. En outre, vous serez un défenseur et un formateur actif en ce qui concerne les meilleures pratiques de gestion et de partage des données.

Missions principales

Être un point de contact central en ce qui concerne les questions liées aux données de recherche à l’institut
Diriger une équipe qui gère les données des études et les bases de données REDCap
Aider les chercheurs en les guidant dans le processus et en établissant le contact avec les bons groupes.
Former et promouvoir les meilleures pratiques en matière gestion des données
Fournir des informations à la DSI sur les domaines dans lesquels l’infrastructure de gestion des données peut être améliorée à l’institut.
Établir des relations entre les équipes et les services de l’entreprise (services juridiques, DPO, DSI, etc.) lorsque cela est nécessaire pour leurs projets.
Créer des estimations et des devis pour le soutien à la gestion des données
Nettoyer et valider les données, en résolvant les problèmes avec le personnel chargé de la collecte des données (Project investigateur, Post-doc, ARCs).

Savoir-faire

Connaissance approfondie des procédures de gestion des données, des meilleures pratiques (Data Management Plan) et des outils de gestion des données (de préférence avec REDCap) ,
Bonne connaissance des bases de données relationnelles (comme mysql ou postgres) et du langage SQL.
Une certaine connaissance de la conformité au GDPR (données sensibles, MR de la CNIL, privacy by design and by default…) est souhaitable.

Savoir

Titulaire d’un master (bac+5) scientifique/biostatistique/bio-informatique/informatique avec des compétences en gestion des données
Expérience en gestion de projet
Bonne expérience de l’environnement de recherche clinique universitaire et de la gestion de cohortes longitudinales.
De bonnes compétences en anglais scientifique.
Une passion pour les données FAIR et la reproductibilité scientifique.

Savoir-être

Capacités d’organisation (individuellement et en équipe)
Autonomie, Rigueur, Adaptabilité
Capacité à travailler en équipe multidisciplinaire
Excellent relationnel
Esprit d’équipe, implication dans un travail collaboratif

Capacité à communiquer avec des chercheurs et du personnel d’horizons divers