Un(e) ingénieur(e) en bio-informatique (H/F)

Poste à pourvoir : Dès que possible
Type de contrat : Contrat à durée déterminée 18 mois
Domaine d'activité : Plateforme technologique
Type d'annonce : ICM

Missions principales :

 Vous participerez à l’analyse et à l’interprétation des données omiques neuro focalisées.

Votre travail consistera à :

  • Assurer l’analyse bio-informatique des données issues des technologies NGS
  • Développer et mettre en place des nouveaux pipelines pour l’analyse bio-informatique
  • Assurer une veille scientifique et technique (rechercher des nouvelles méthodes/logiciels pur l’analyse du séquençage à haut débit).
  • Fournir une expertise et des conseils méthodologiques aux équipes de recherche ;
  • Accompagner les équipes et les projets de recherche dans la mise en place des plans d’analyse et le traitement des données biologiques et médicales ;
  • Participer à des missions de formation en bio-informatique destinés aux biologistes, cliniciens et médecins.

Savoir :

  • Expérience professionnelle souhaitée d’au moins un an dans le domaine souhaité
  • Diplômes : Bac+5 (master ou ingénieur) en bio-informatique, ou niveau équivalent en biologie/informatique complété par une expérience professionnelle dans l’autre domaine

Savoir Faire :

  • Expertise en analyse de données génomiques
  • Maîtrise des environnements UNIX (shell)
  • Maîtrise de la programmation (notamment des langages de script et R)
  • Bonnes connaissances des outils standards de bio-informatique pour l’analyse et l’interprétation des données de séquençage haut-débit (DNA, RNAseq, Single-Cell RNAseq)
  • Pratique experte d’au moins une méthode d’analyse des données NGS
  • Autonomie pour apprendre rapidement des nouvelles méthodes adaptées à la grande variété des données
  • Des compétences dans les domaines suivants serait un plus: versionnage du code avec GIT, utilisation de cluster de calcul (SLURM), utilisation de gestionnaire de workflow type Snakemake

Savoir-être :

  • Bonne maîtrise de l’anglais scientifique ;
  • Capacité d’intégration au sein d’une équipe multidisciplinaire;
  • Capacité de communication avec des chercheurs venant d’horizons scientifiques variés ;
  • Motivation pour les projets complexes et pour faire avancer la recherche en Neurosciences !