Archives

Un(e) Ingénieur(e) de Recherche (H/F)

Missions principales

  • L’ingénieur de recherche est chargé de l’analyse des données électrophysiologiques obtenues lors d’expérimentations dans le cadre de protocoles de recherche biomédicale portant sur la personne humaine.
  • Interactions avec l’équipe (cliniciens, chercheurs, ARC, etc…)
  • Réaliser le traitement et l’analyse des données en vue de leur interprétation,
  • Evaluer les différentes méthodes d’analyse et choisir les plus appropriées selon les objectifs du programme de recherche
  • Proposer des évolutions dans l’analyse des données électrophysiologiques en fonction des besoins nouveaux
  • Organiser et contrôler les interventions de maintenance préventive et les interventions de dépannage

Savoir-faire

  • Il/elle saura réaliser les systèmes de prise de mesure, d’acquisition et de traitement des données ainsi que traduire une demande en spécifications techniques.
  • Il/elle saura planifier une demande en spécifications techniques.

 Savoir

  • Le/la candidat(e) aura un niveau ingénieur (thèse de science) avec une expérience professionnelle en qualité d’ingénieur de recherche dans le domaine de l’électrophysiologie et l’analyse du mouvement.
  • Le/la candidat(e) aura des connaissances approfondies des méthodes d’analyse et du traitement du signal électrophysiologique
  • Il/elle maitrisera les logiciels suivants : logiciel d’acquisition, MATLAB (the MathWorks®), Pack Office (Word, Excel, Powerpoint), statistiques (R®)
  • Il/elle aura de bonnes connaissances en statistiques
  • Il/elle maîtrisera l’anglais technique lu et écrit

Savoir-être

  • Le/la candidat(e) s’intégrera dans une équipe dynamique et travaillera en étroite relation avec le responsable du projet et d’autres chercheurs/personnel technique.
  • Il/elle fera preuve d’une grande autonomie, d’un bon relationnel, ainsi que d’une bonne capacité d’interaction et de communication.
  • Le/la candidat(e) sera amené(e) à être en contact direct avec les sujets venant participer aux expérimentations (volontaires et patients atteints de pathologies neurologiques)

Ingénieur en Calcul scientifique HPC (F/H)

Voici l’ensemble de vos missions :
Administration des serveurs scientifiques (grappe de calcul, stockage haute performance Infiniband)

Optimisation et parallélisation de code, analyse, compréhension et optimisation des jobs de calcul

Développement Opérationnel (DevOps) de codes et applications scientifiques

Portabilité / Reproductibilité́ des applications via la mise en œuvre de container (Docker, Singularity)

Support aux équipes pour le développement d’outils nécessaires leurs activités

Valorisation, optimisation et déploiement des applications créées en interne sur le cluster de calcul

Formation, conseil et assistance aux utilisateurs utilisant les infrastructures IT scientifiques

Veille technologique sur les matériels et les outils logiciels

Exemples de projets sur lesquels vous serez impliqué(e) :

1. Accompagner les équipes sur l’utilisation des ressources de calcul intensif institutionnelles (Genci,
mesocentre) et du cloud public (AWS)

2. Participer à la mise en place de nouvelles ressources de calcul CPU et GPU:

a. Réflexion sur la gestion des flux de données et processus de traitement des données

b. Optimisation de l’accès aux données et à la gestion des partitions de l’orchestrateur

c. Maintien des codes et systèmes en conditions opérationnelles

Profil recherché :


Vous êtes titulaire d’un Bac + 4/5 en Systèmes d’Information et justifiez d’au moins 5 ans
d’expérience dans un environnement similaire, au sein d’une DSI ou d’une société de conseil.

Vous maîtrisez l’administration de système Linux, les techniques d’optimisation et de distribution de calculs (MPI, OpenMP,..) et les ordonnanceurs de grappe de calcul (Slurm, Torque, LSF, PBS,…).
– Des compétences en algorithmes et programmation distribuée sont nécessaires.

Vous êtes expert(e) des outils d’administration et de monitoring et connaissez parfaitement l’utilisation des machines virtuelles et container.

Vous avez de bonnes notions des réseaux hautes performances (type Infiniband), êtes à l’aise avec un ou plusieurs langages de programmation (Python est très utilisé) avec de bonnes capacités rédactionnelles (notes techniques, formations).

 

Un(e) assistant ingénieur en techniques biologiques (H/F)

MISSIONS PRINCIPALES

  • Réalisation de prestations de services dans le cadre de projets académiques ou industriels et rédaction des rapports
  • Production de cultures cellulaires (cultures primaires, lignées)
  • Mesure de paramètres biologiques et tests fonctionnels
  • Imagerie cellulaire
  • Formation des nouveaux entrants aux principes de base de la culture cellulaire et à l’utilisation des équipements
  • Acquisition et transmission des savoir-faire et des techniques
  • Gestion des espaces communs de la plateforme et des stocks de consommables
  • Supervision du matériel mise à disposition : organisation des maintenances, surveillance
  • Aide à la gestion administrative de la plateforme : commandes, facturation, inventaire, mailing, affichage…

 

SAVOIR 

  • Niveau Bac+3
  • Bonne connaissance des règles d’hygiène et de sécurité
  • Connaissances générales en biologie
  • Habilitation en expérimentation animale (niveau opérateur ou concepteur)

 

SAVOIR – FAIRE

  • Maîtrise des principes et des techniques de base de culture cellulaire et de biologie cellulaire : production, maintenance et traitements des cultures ; techniques de transfection ; détection par immunofluorescence ; comptage cellulaire ; observation au microscope ; dosages ELISA ; …
  • Une expérience préalable du travail en plateforme serait un plus
  • Maîtrise de l’outil informatique : bureautique de base et logiciels de gestion de plannings, de stocks et de commandes
  • Maîtrise de l’anglais scientifique

 

SAVOIR – ETRE 

  • Motivation, autonomie, dynamisme, sens de l’organisation et qualités relationnelles
  • Savoir rendre compte de son activité et transmettre des savoir-faire

Un(e) Ingénieur(e) d’étude(H/F) – Plateforme d’histologie

Au sein de la plateforme d’histologie, l’ingénieur(e) d’étude aura en charge des expériences de transcriptomique spatiale. Elle/il réalisera les coupes de tissus, dédiées à cette technologie innovante d’analyse d’expression de gènes. Elle/il effectuera les expériences de transcriptomique spatiale sur des automates de dernière génération, et assurera le suivi et l’interprétation des expériences, en lien étroit avec les plateformes de génomique et de bio-informatiques de l’Institut du Cerveau. Elle/il devra être capable d’interagir avec les équipes de recherche et discuter les résultats en Anglais et en Français.

Missions principales

  • Assurer la préparation et la coupe de tissus pour les expériences de transcriptomique spatiale.
  • Réaliser les expériences d’immunohistochimie et/ou de colorations histologiques, nécessaires à la sélection de régions d’intérêt pour la transcriptomique spatiale
  • Mettre en place des workflows avancés pour la transcriptomique spatiale, par exemple : segmentation d’images, quantification de la distribution de transcrits et/ou protéines
  • Réaliser les premières analyses de standards des données de transcriptomique spatiale
  • Organiser et contrôler l’utilisation collective des appareillages et des postes de travail
  • Maintenir, répertorier et promouvoir les techniques de transcriptomique spatiale, sous la direction des responsables opérationnel et scientifique de la plateforme
  • Former les scientifiques à l’utilisation des techniques de transcriptomique spatiale et rédiger des procédures
  • Conseiller les utilisateurs sur les possibilités techniques, leurs limites, les méthodes d’analyse, leur interprétation, et en assurer le suivi
  • Rédiger des rapports d’expériences ou d’études, des notes techniques
  • Travailler en étroite collaboration avec les équipes scientifiques, la plateforme de génomique et d’analyse de données, pour mettre en œuvre des protocoles innovants permettant de localiser et de quantifier, de manière fines, l’expression de gènes ou de protéines.
  • Participer aux réunions de projet
  • Communiquer sur les avancées des techniques de transcriptomique spatial lors de conférences scientifiques (internes et externes) ou dans des journaux scientifiques
  • Assurer l’application des principes et des règles d’hygiène et de sécurité et mettre en œuvre une démarche qualité et un suivi métrologique des équipements
  • Assurer la veille scientifique dans ce domaine émergeant

 

PROFIL:

  • Diplôme requis : Licence à Master ou équivalent
  • Expérience professionnelle acquise :  3 à 5 ans
  • Très bonnes connaissances en histologie (coupes, coloration histologiques et immunohistochimie), et en particulier de l’histologie du système nerveux
  • Très bonnes compétences en biologie moléculaire (ISH, RNAscope, FISH…)
  • Bonnes connaissances des techniques de génomique (extractions d’ARN, qPCR, RNAseq…)
  • Notion en analyse de données souhaitée mais non requise (langage R et /ou Python)
  • Très bonne capacité rédactionnelle et de communication scientifique (Anglais et Français)
  • Maîtrise des outils informatiques
  • Autonomie et rigueur
  • Excellente capacité d’organisation
  • Excellente capacité de travail en équipe multidisciplinaire

 

Un·e chargé·e de communication interne (H/F)

Au sein de la Direction de la Communication et du Développement, dans l’équipe Communication, le·la Chargé·e de Communication interne aura pour mission d’épauler la Responsable Communication interne dans la mise en œuvre et le suivi du plan de communication interne en liaison avec les différentes parties prenantes de l’Institut. Le·la stagiaire aura notamment pour mission de produire des contenus attrayants en synergie avec les différentes équipes de l’Institut et permettant la valorisation des activités et talents auprès du public interne (articles, vidéos, e-mails groupe, etc.). 

Missions principales

  • Mise à jour des supports de communication interne
    • Intégration de la newsletter hebdomadaire
    • Animation du contenu sur le site intranet
    • Mise à jour de l’affichage dynamique
  • Soutien à l’organisation de certains événements internes, de la préparation logistique à la production de contenus (moments de convivialité/ événements sportifs/prises de paroles de la direction, etc.)
  • Mise en place des différents sondages internes

Missions secondaires

  • Tenue de présentations et reportings réguliers auprès de la Direction
  • Participation aux actions transverses portées par toute l’équipe
  • Être force de proposition pour la réalisation de nouveaux supports & contenus

 

Savoir-faire

  • En préparation de votre diplôme en Communication ou Événementiel (en université ou école spécialisée type Sorbonne, CELSA, EFAP ou autre)
  • Vous disposez d’une première expérience en stage ou autre avec des missions similaires à celles du poste

Savoir

  • Maîtrise des principaux logiciels de bureautique (dont le pack Microsoft 365) et connaissance de logiciels de PAO (Suite Adobe, Canva) souhaitée
  • L’utilisation d’outils de création vidéo, de CMS et d’envoi de newsletter lors d’une expérience précédente est un plus
  • Anglais courant

Savoir-Être

  • Forte appétence pour la communication interne et événementielle
  • Excellent relationnel et esprit d’équipe
  • Sens de l’observation et de l’écoute
  • De nature curieuse et créative
  • Autonomie, rigueur et organisation

 

 

Un(e) post-doctorant(e) (H/F)

Matthieu Peyre, membre de l’équipe « Génétique et développement des tumeurs cérébrales » à l’Institut du Cerveau, cherche un/e chercheur/se post-doctorant/e intéressé/e par un projet translationnel sur les cavernomes cérébraux pour lequel il sera en autonomie. Ce projet financé par l’ANR qui consiste à créer de nouveaux modèles souris génétiquement modifiés de cavernomes sporadiques, à en réaliser l’évaluation pré-clinique, tout en réalisant en parallèle une étude clinique, radiologique et moléculaire sur les cavernomes humains. Ce projet fait suite à un premier travail publié dans le New England Journal of Medicine en 2021 et repose sur une double expertise en modélisation animale et génétique humaine. Ce poste de post-doctorant d’une durée de 36 mois débuterait le 01/01/2023.

 

Missions principales

  • Création et caractérisation de modèles souris génétiquement modifiés innovants de cavernomes cérébraux
  • Etude pré-clinique chez la souris
  • Projet humain d’analyse single cell et de machine learning théranostique     

  

Savoir-faire

  • Maîtrise des techniques de base d’expérimentation animale (anesthésie, chirurgie, traitements)
  • Maîtrise des techniques de base de biologie moléculaire (multi-omics, ddPCR) et culture cellulaire
  • Maîtrise des techniques d’analyses statistiques avec le logiciel R

Savoir

  • Doctorat en Oncologie ou Neurosciences ou équivalent
  • Formation à l’expérimentation animale (niveau 1 et niveau de chirurgie souhaitable)
  • Connaissances approfondies en modèles souris génétiquement modifiés
  • Connaissances en biologie moléculaire et notamment multi-omics et single cell
  • Connaissance des techniques d’immunohistochimie, microscopie, analyse d’images
  • Maîtrise de l’anglais écrit et parlé

Savoir-être

  •  Autonomie, sens de l’initiative, sens du contact
  • Capacité à travailler dans un environnement interdisciplinaire (biologistes, médecins) et international 

Un(e) neurologue PH (H/F)

L’Institut du cerveau est un centre de recherche totalement dédié à la recherche sur les maladies neurologiques et neurodégénératives, qui comprend en son sein des cliniciens chercheurs, des chercheurs en neuroscience et fondamentaux. L’institut s’appuie sur des ressources exceptionnelles dans les domaines de la neuro-imagerie, de la génétique, des neurosciences cognitives, de la biologie, de l’électrophysiologie. L’équipe travaille sur les démences dégénératives, en particulier sur les démences Frontotemporale (DFT) en liaison étroite avec les équipes médicales de l’institut de la mémoire et de la maladie d’Alzheimer (IMMA).

Le(a) candidat(e) participera à des projets de recherche clinique sur les démences dégénératives au sein de l’ICM. Les projets de l’équipe portent sur les formes génétiques de DFT. Il s’agit de projets de recherche clinique et translationnelle, visant à identifier des marqueurs biologiques, d’imagerie cérébrale (IRM/TEP) et troubles cognitifs précoces de la DFT, et leurs bases neuroanatomiques.

Les données exploitées par le(a) candidat(e) sont issues de cohortes de patients DFT (Predict-PGRN PrevDemALS et RBM02-59).

Possibilité d’une activité de soins (consultations à l’IMMA) en complément de l’activité de recherche.

Le contrat est renouvelable et peut s’intégrer dans le cadre d’une thèse de sciences si souhaité.

Possibilité de participer à de nombreuses formations à l’évaluation cognitive des patients, aux outils statistiques et d’analyses d’imagerie au sein de l’institut (ICM) et de l’équipe clinique qui y est rattachée (IMMA).

Participation à des congrès nationaux et internationaux, intégration dans les réunions des consortiums de recherche, présentation des résultats aux congrès, participation aux publications de recherche.

Il/Elle participera au recrutement des patients, à leur évaluation clinique et à leur suivi, et à l’analyse des données.

Le(a) candidat(e) travaillera à l’interface de deux équipes de l’ICM : l’équipe BTWIN (génétique) et FrontLab (neurosciences cognitives) sous la responsabilité du Dr Isabelle Le Ber. Au sein de l’équipe, il/elle interagira avec des cliniciens chercheurs, chercheurs, cheffe de projet, neuropsychologues et orthophonistes, et personnel technique.

Il/elle interagira étroitement avec l’équipe clinique (IMMA) et l’équipe ARAMIS (analyses d’imagerie) ainsi qu’avec les nombreuses équipes de l’ICM et le LIB.

Travail en relation avec les équipes cliniques (IMMA),

 

PROFIL

Savoir-faire

  • Le(a) candidat(e) devra être neurologue expérimenté(e), titulaire d’un DES de neurologie (ou éventuellement en fin de cursus de formation).
  • Idéalement, un master, une bonne connaissance des pathologies cognitives et comportementales, des outils informatiques et des analyses statistiques et logiciels d’analyse d’imagerie seraient un plus. 
  • Responsabilité du bon déroulement des projets, de la réalisation des analyses, de l’évaluation des patients, des gestions de cohortes, publications et présentation aux congrès. Suivi bibliographique sur la thématique de recherche.

Savoir

  • Connaissance sur les DFT, cognition, statistiques, logiciels d’analyse d’imagerie
  • Bonne maitrise de la langue française et anglaise

 

Savoir-être

  • Bonne intégration dans les équipes de recherche, respect des autres, respect des horaires de travail, des règlements au sein de l’ICM et de l’IMMA, BPC.
  • Capacité à travailler en équipe, dynamisme, autonomie, et curiosité scientifique.

Un(e) post-doctorant(e) (H/F)

Le(a) post-doctorant(e) recruté(e) sera en charge d’un programme de recherches visant à caractériser in vivo dans un modèle génétique d’épilepsie-absence les effets aigus et les effets à long-terme de stimulations magnétiques de basse intensité (LI-rTMS) sur la fréquence de survenue et la durée des crises. Le(a) chercheur(se) devra notamment réaliser des enregistrements EEG combinés à des enregistrements intracellulaires chez des animaux ayant reçu une session unique (effet aigu) ou des sessions répétées (effet à long-terme) de stimulations magnétiques. Le travail expérimental du (de la) chercheur(se) recruté(e) sera réalisé dans l’équipe de Stéphane Charpier au sein de l’ICM. Une expérience dans un laboratoire de recherche en électrophysiologie depuis plus de 5 ans est requise.

Missions principales :

  • Réalisation d’enregistrements EEG, LFP et intracellulaires de neurones corticaux dans un modèle de rongeur in vivo.
  • Analyse et traitement des signaux électrophysiologiques
  • Marquage intracellulaire ou juxta-cellulaire in vivo des neurones, perfusion, traitement histologique, reconstruction 3D (avec l’aide d’une histologiste)
  • Rédaction de publications scientifiques
  • Supervision d’un étudiant en thèse
  • Enregistrements EEG et LFP chez des animaux vigils ayant subi 10 jours de stimulation avec l’aide de la plateforme Phenoparc

 

Savoir-faire

  • Maîtrise des techniques d’enregistrements intracellulaires et extracellulaires (EEG, LFP, multi- et single-unit) in vivo
  • Maîtrise des outils informatiques permettant l’analyse des données (Spike2, MatLab, Origin, Igor)
  • Maîtrise des techniques de marquage cellulaire in vivo
  • Fabrication d’électrodes

 

Savoir

  • Doctorat en Neurosciences ou équivalent
  • Formation à l’expérimentation animale (niveau 1 et niveau de chirurgie souhaitable)
  • Expertise théorique en électrophysiologie cellulaire et de réseau
  • Connaissances approfondies en physiologie animale et en anesthésiologie
  • Connaissances en électronique
  • Connaissance des techniques de pharmacologie et d’immunohistochimie
  • Connaissance théoriques et techniques en LI-rTMS
  • Maîtrise de l’anglais écrit et parlé

Savoir-être

  •  Autonomie, sens de l’initiative, sens du contact 

Un(e) Ingénieur(e) de Recherche (H/F)

Missions principales

  • L’ingénieur de recherche est chargé de l’analyse des données électrophysiologiques obtenues lors d’expérimentations dans le cadre de protocoles de recherche biomédicale portant sur la personne humaine.
  • Interactions avec l’équipe (cliniciens, chercheurs, ARC, etc…)
  • Réaliser le traitement et l’analyse des données en vue de leur interprétation,
  • Evaluer les différentes méthodes d’analyse et choisir les plus appropriées selon les objectifs du programme de recherche
  • Proposer des évolutions dans l’analyse des données électrophysiologiques en fonction des besoins nouveaux
  • Organiser et contrôler les interventions de maintenance préventive et les interventions de dépannage

Savoir-faire

  • Il/elle saura réaliser les systèmes de prise de mesure, d’acquisition et de traitement des données ainsi que traduire une demande en spécifications techniques.
  • Il/elle saura planifier une demande en spécifications techniques.

 Savoir

  • Le/la candidat(e) aura un niveau ingénieur (thèse de science) avec une expérience professionnelle en qualité d’ingénieur de recherche dans le domaine de l’électrophysiologie et l’analyse du mouvement.
  • Le/la candidat(e) aura des connaissances approfondies des méthodes d’analyse et du traitement du signal électrophysiologique
  • Il/elle maitrisera les logiciels suivants : logiciel d’acquisition, MATLAB (the MathWorks®), Pack Office (Word, Excel, Powerpoint), statistiques (R®)
  • Il/elle aura de bonnes connaissances en statistiques
  • Il/elle maîtrisera l’anglais technique lu et écrit

Savoir-être

  • Le/la candidat(e) s’intégrera dans une équipe dynamique et travaillera en étroite relation avec le responsable du projet et d’autres chercheurs/personnel technique.
  • Il/elle fera preuve d’une grande autonomie, d’un bon relationnel, ainsi que d’une bonne capacité d’interaction et de communication.
  • Le/la candidat(e) sera amené(e) à être en contact direct avec les sujets venant participer aux expérimentations (volontaires et patients atteints de pathologies neurologiques)

Un(e) Data Manager Senior (H/F)

Nous recherchons actuellement une personne capable de coordonner la gestion des données à l’Institut du cerveau de Paris. Si vous êtes la personne que nous recherchons, vous guiderez, formerez et soutiendrez les équipes et les plateformes de recherche sur la bonne approche pour leur gestion de données. Vous les guiderez tout au long du cycle de vie de leurs données. Cela comprend : la création de plans de gestion des données, l’utilisation de formats et de systèmes corrects, la communication avec la DSI, la communication avec le service juridique et le DPD de l’institut, et le stockage à long terme de l’ensemble de données. Le poste exige la capacité d’assurer la liaison avec un grand nombre d’entités de l’institut, tant dans le domaine scientifique que dans le domaine administratif. En outre, vous serez un défenseur et un formateur actif en ce qui concerne les meilleures pratiques de gestion et de partage des données.

Missions principales

  • Être un point de contact central en ce qui concerne les questions liées aux données de recherche à l’institut
  • Diriger une équipe qui gère les données des études et les bases de données REDCap
  • Aider les chercheurs en les guidant dans le processus et en établissant le contact avec les bons groupes.
  • Former et promouvoir les meilleures pratiques en matière gestion des données
  • Fournir des informations à la DSI sur les domaines dans lesquels l’infrastructure de gestion des données peut être améliorée à l’institut.
  • Établir des relations entre les équipes et les services de l’entreprise (services juridiques, DPO, DSI, etc.) lorsque cela est nécessaire pour leurs projets.
  • Créer des estimations et des devis pour le soutien à la gestion des données
  • Nettoyer et valider les données, en résolvant les problèmes avec le personnel chargé de la collecte des données (Project investigateur, Post-doc, ARCs).

Savoir-faire

  • Connaissance approfondie des procédures de gestion des données, des meilleures pratiques (Data Management Plan) et des outils de gestion des données (de préférence avec REDCap) ,
  • Bonne connaissance des bases de données relationnelles (comme mysql ou postgres) et du langage SQL.
  • Une certaine connaissance de la conformité au GDPR (données sensibles, MR de la CNIL, privacy by design and by default…) est souhaitable.

Savoir

  • Titulaire d’un master (bac+5) scientifique/biostatistique/bio-informatique/informatique avec des compétences en gestion des données
  • Expérience en gestion de projet
  • Bonne expérience de l’environnement de recherche clinique universitaire et de la gestion de cohortes longitudinales.
  • De bonnes compétences en anglais scientifique.
  • Une passion pour les données FAIR et la reproductibilité scientifique.

 Savoir-être

  • Capacités d’organisation (individuellement et en équipe)
  • Autonomie, Rigueur, Adaptabilité
  • Capacité à travailler en équipe multidisciplinaire
  • Excellent relationnel
  • Esprit d’équipe, implication dans un travail collaboratif
  • Capacité à communiquer avec des chercheurs et du personnel d’horizons divers